在过去的50年里,宗教在荷兰社会生活中的影响越来越小。在日渐加剧的世俗化趋势下,以前常去做礼拜的人数现在越来越少,特别是最近的三十年。据 2002年数据(来源:荷兰中央统计局)显示,荷兰40%的人不信奉任何宗教,其余的60%中,几乎三分之一的人信奉罗马天主教,14%的人信奉荷兰归正教,7%的人信奉加尔文教。约有8%的人信奉其它宗教,其中包括伊斯兰教、印度教和犹太教。如今,伊斯兰教是荷兰唯一信教人数在增长的宗教。
随着罗马帝国的扩张,天主教风靡整个欧洲,并在公元1世纪积聚了强大的力量。公元7世纪,天主教最终到达了"低地之国"荷兰,在那里找到了孕育异教思想的肥沃土壤。
新教这个深深影响了荷兰国家历史的教派则来得更晚;直到16世纪,马丁·路德(Martin Luther)和约翰·加尔文(John Calvin)的激进基督思想才得以形成,之后便很快在荷兰贵族中吸引了众多追随者。
激进基督思想的形成导致了和当时统治这个国家的天主教西班牙人之间不可避免的冲突:争论和仇恨的激化导致了16世纪和17世纪间的"八十年战争"。新教徒由奥兰治家族的威廉亲王领导,在10年战争后,威廉宣布宗教和平,鼓励当时低地之国中的新教徒和天主教徒共同抵抗西班牙统治者。在这种倡导下,战争在接下来的几十年中断断续续地进行,到了1648年,荷兰终于摆脱了西班牙的统治。
尽管天主教徒和新教徒是分开的群体,在社会上并没有融合,但两个宗教教派却持续合作,推进了荷兰文化、科学和经济的空前发展。荷兰越发繁荣,17世纪后期开始被看作是"黄金时期"。
从那时起,新教经历了许多改变;自1834年起内部支派开始严重分裂。许多新的群体都选择了他们自己的路线,每一个分支派系针对整体教义都有着自己独到的见解。荷兰归正会(Dutch Reformed Church)仍是荷兰最大的新教教会。
随着世界各地移民的蜂拥而至,基督教以外的其它宗教也在这个低地国家随之兴起。自17世纪以来,许多西班牙和葡萄牙的难民定居于此,荷兰开始有了犹太人社区。之后,在二十世纪,许多犹太人为了逃离纳粹政权,从东欧来到这里。首批印度人和穆斯林人来自前荷兰殖民地印尼群岛、苏里南以及荷属安的列斯群岛。二十世纪六十年代,荷兰人从土耳其和摩洛哥带来大批廉价劳动力,即所谓的"外来劳工",穆斯林社区也由此迅速增加。
1848年颁布的《荷兰宪法》保护宗教自由,教会与政府得以分离。政府不干涉宗教或信仰组织的内部事宜。