Instance Manager使用标准my.cnf文件。它使用[manager]部分为自己读取选项并读取[mysqld]部分来创建实例。[manager]部分包含上述列出的选项。下面为[manager]部分示例：
# MySQL Instance Manager options section
[manager]
default-mysqld-path = /usr/local/mysql/libexec/mysqld
socket=/tmp/manager.sock
pid-file=/tmp/manager.pid
password-file = /home/cps/.mysqlmanager.passwd
monitoring-interval = 2
port = 1999
bind-address = 192.168.1.5
MySQL实例管理器只在Unix中读取并管理/etc/my.cnf文件。在Windows中，MySQL实例管理器从Instance Manager的安装目录读取my.ini文件。用--defaults-file=file_ name选项可以更改默认选项文件的位置。
实例部分指定启动时给每个实例的选项。这些主要是普通MySQL服务器选项，但有一些IM-专用选项：
·mysqld-path = <path-to-mysqld-binary>
mysqld服务器二进制的路径。
·shutdown-delay = Seconds
IM应等待实例关闭的秒数。 默认为35秒。超过延迟时间后，IM假定实例正挂起并试图“kill –9”它。如果你使用带large表的InnoDB，你应当增加该值。
·nonguarded
如果你想要为某个实例禁用IM监视功能，应设置该选项。
下面给出了几个实例示例。
[mysqld]
mysqld-path=/usr/local/mysql/libexec/mysqld
socket=/tmp/mysql.sock
port=3307
server_id=1
skip-stack-trace
core-file
skip-bdb
log-bin
log-error
log=mylog
log-slow-queries
[mysqld2]
nonguarded
port=3308
server_id=2
mysqld-path= /home/cps/mysql/trees/mysql-5.1/sql/mysqld
socket = /tmp/mysql.sock5
pid-file = /tmp/hostname.pid5
datadir= /home/cps/mysql_data/data_dir1
language=/home/cps/mysql/trees/mysql-5.1/sql/share/english
log-bin
log=/tmp/fordel.log
